都被唐河中节度使王重荣所败，朱温惧怕黄巢的处罚，便在农民军与唐军即将决战的关键时刻，率部投降了唐政府，迫使黄巢撤出长安，成为导致起义最终失败的罪魁祸首。

朱温叛降后，被唐政府封为左金吾大将军，河中行营招讨副使，僖宗赐名全忠，后又被授予宣武节度使之职，参加镇压黄巢起义。在这期间，朱温也同其他军阀一样，利用机会发展自己的势力，他先后吞并了秦宗权的领地及徐州，又夺取朱碹兄弟的兖、郓二州，成为东方势力最大的军阀。他与关中军阀李茂贞、沙陀人李克用鼎足三立，展开了激烈的争斗。从此兵连祸结，国无宁日。唐昭宗天复年间，宦官中尉韩全诲与李茂贞相勾结，劫持昭宗至凤翔，宰相崔胤一向以朱温做靠山，便悄悄致书朱温，让他出兵从李茂贞手中抢回昭宗，朱温便率军西进，以七万大军围凤翔，李茂贞屡战屡败，最后弹尽粮绝无计可施，只好交出傀儡皇帝，朱温兵挟持昭宗返回长安。这次较量中，李茂贞一败涂地，关中之地尽入朱温之手，山南之地又被另一军阀王建乘机夺去，李茂贞从此失势。